Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
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GTF3C1Q12789 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GTF3C1Q12789 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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GTF3C1Q12789 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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GTF3C1Q12789 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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GTF3C1Q12789 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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GTF3C1Q12789 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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GTF3C1Q12789 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF3C1Q12789 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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