Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HMGXB3Q12766 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HMGXB3Q12766 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
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