Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SSRP1Q08945 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms