Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC1Q08554 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DSC1Q08554 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms