Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LOXL1Q08397 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LOXL1Q08397 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms