Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LRP1Q07954 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms