Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TFF3Q07654 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TFF3Q07654 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms