Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALD1Q05682 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALD1Q05682 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms