Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNEQ04844 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms