Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYP4A11Q02928 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms