Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms