Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC6A3Q01959 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms