Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN7AQ01118 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN7AQ01118 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms