Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPTBN1Q01082 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPTBN1Q01082 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms