Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDK5Q00535 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDK5Q00535 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms