Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms