Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRX3P78415 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRX3P78415 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX3P78415 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX3P78415 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX3P78415 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX3P78415 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX3P78415 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX3P78415 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX3P78415 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX3P78415 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX3P78415 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX3P78415 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX3P78415 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX3P78415 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX3P78415 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX3P78415 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX3P78415 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX3P78415 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX3P78415 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX3P78415 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX3P78415 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX3P78415 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX3P78415 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX3P78415 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX3P78415 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX3P78415 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX3P78415 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX3P78415 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX3P78415 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX3P78415 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms