Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HBBP68871 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HBBP68871 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HBBP68871 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
HBBP68871 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HBBP68871 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HBBP68871 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HBBP68871 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HBBP68871 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HBBP68871 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HBBP68871 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms