Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKP1P63208 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKP1P63208 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKP1P63208 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKP1P63208 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKP1P63208 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKP1P63208 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKP1P63208 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKP1P63208 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKP1P63208 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKP1P63208 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKP1P63208 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKP1P63208 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms