Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P63132 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms