Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HERV-K104P61576 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms