Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRP6P59044 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP6P59044 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms