Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBASH3AP57075 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms