Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H2BFSP57053 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms