Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFDNP55196 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFDNP55196 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFDNP55196 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFDNP55196 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFDNP55196 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFDNP55196 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFDNP55196 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AFDNP55196 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFDNP55196 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFDNP55196 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFDNP55196 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFDNP55196 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFDNP55196 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFDNP55196 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFDNP55196 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFDNP55196 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFDNP55196 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFDNP55196 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFDNP55196 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFDNP55196 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFDNP55196 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFDNP55196 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFDNP55196 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AFDNP55196 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFDNP55196 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFDNP55196 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFDNP55196 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFDNP55196 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFDNP55196 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFDNP55196 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFDNP55196 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFDNP55196 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFDNP55196 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFDNP55196 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFDNP55196 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms