Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AQP4P55087 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AQP4P55087 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AQP4P55087 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AQP4P55087 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AQP4P55087 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AQP4P55087 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AQP4P55087 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms