Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATN1P54259 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATN1P54259 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATN1P54259 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATN1P54259 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATN1P54259 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATN1P54259 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATN1P54259 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATN1P54259 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATN1P54259 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms