Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRAP54198 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRAP54198 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRAP54198 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRAP54198 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRAP54198 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRAP54198 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRAP54198 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRAP54198 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRAP54198 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRAP54198 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRAP54198 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRAP54198 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRAP54198 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRAP54198 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRAP54198 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRAP54198 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRAP54198 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRAP54198 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRAP54198 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRAP54198 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRAP54198 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRAP54198 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRAP54198 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRAP54198 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRAP54198 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRAP54198 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRAP54198 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRAP54198 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRAP54198 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRAP54198 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRAP54198 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRAP54198 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRAP54198 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRAP54198 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRAP54198 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRAP54198 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRAP54198 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRAP54198 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRAP54198 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRAP54198 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRAP54198 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRAP54198 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRAP54198 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRAP54198 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRAP54198 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRAP54198 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRAP54198 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRAP54198 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRAP54198 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRAP54198 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRAP54198 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRAP54198 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRAP54198 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRAP54198 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRAP54198 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRAP54198 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRAP54198 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRAP54198 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRAP54198 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRAP54198 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRAP54198 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRAP54198 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRAP54198 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRAP54198 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRAP54198 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRAP54198 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRAP54198 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRAP54198 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRAP54198 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRAP54198 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRAP54198 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRAP54198 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRAP54198 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRAP54198 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRAP54198 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRAP54198 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRAP54198 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms