Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSBP53539 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSBP53539 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSBP53539 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSBP53539 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSBP53539 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms