Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EFNA4P52798 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms