Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EFNA3P52797 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EFNA3P52797 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms