Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KPNA1P52294 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KPNA1P52294 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms