Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SMARCA4P51532 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms