Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRE11P49959 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRE11P49959 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRE11P49959 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRE11P49959 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MRE11P49959 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRE11P49959 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRE11P49959 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRE11P49959 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRE11P49959 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRE11P49959 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRE11P49959 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRE11P49959 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRE11P49959 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRE11P49959 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRE11P49959 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRE11P49959 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRE11P49959 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRE11P49959 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRE11P49959 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRE11P49959 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRE11P49959 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MRE11P49959 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRE11P49959 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MRE11P49959 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRE11P49959 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRE11P49959 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRE11P49959 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRE11P49959 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRE11P49959 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRE11P49959 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRE11P49959 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRE11P49959 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms