Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRIM1P49642 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRIM1P49642 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms