Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTRNP46939 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTRNP46939 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTRNP46939 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTRNP46939 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTRNP46939 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTRNP46939 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTRNP46939 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTRNP46939 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTRNP46939 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UTRNP46939 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UTRNP46939 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UTRNP46939 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
UTRNP46939 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UTRNP46939 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UTRNP46939 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTRNP46939 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTRNP46939 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTRNP46939 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTRNP46939 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTRNP46939 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTRNP46939 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTRNP46939 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTRNP46939 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTRNP46939 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UTRNP46939 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTRNP46939 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UTRNP46939 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTRNP46939 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTRNP46939 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTRNP46939 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTRNP46939 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTRNP46939 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTRNP46939 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTRNP46939 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTRNP46939 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UTRNP46939 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTRNP46939 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTRNP46939 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTRNP46939 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTRNP46939 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTRNP46939 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTRNP46939 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UTRNP46939 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTRNP46939 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UTRNP46939 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UTRNP46939 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTRNP46939 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTRNP46939 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTRNP46939 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTRNP46939 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UTRNP46939 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTRNP46939 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTRNP46939 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTRNP46939 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTRNP46939 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTRNP46939 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTRNP46939 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTRNP46939 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTRNP46939 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTRNP46939 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTRNP46939 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTRNP46939 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTRNP46939 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTRNP46939 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UTRNP46939 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTRNP46939 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTRNP46939 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTRNP46939 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTRNP46939 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTRNP46939 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTRNP46939 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTRNP46939 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTRNP46939 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTRNP46939 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UTRNP46939 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTRNP46939 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTRNP46939 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTRNP46939 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms