Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNPDA1P46926 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms