Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACADSBP45954 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACADSBP45954 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms