Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP62P37198 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP62P37198 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP62P37198 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms