Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM23P36406 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms