Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJC1P36383 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GJC1P36383 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GJC1P36383 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
GJC1P36383 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJC1P36383 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJC1P36383 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms