Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL9P32969 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL9P32969 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL9P32969 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL9P32969 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL9P32969 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL9P32969 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL9P32969 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL9P32969 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL9P32969 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL9P32969 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL9P32969 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL9P32969 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL9P32969 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL9P32969 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL9P32969 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL9P32969 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL9P32969 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL9P32969 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms