Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA9P31269 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA9P31269 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms