Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXD10P28358 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms