Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGB2P26583 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGB2P26583 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms