Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PTAFRP25105 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms