Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SPRR1BP22528 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms