Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCL3P20749 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCL3P20749 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCL3P20749 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCL3P20749 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCL3P20749 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCL3P20749 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCL3P20749 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCL3P20749 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCL3P20749 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCL3P20749 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCL3P20749 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCL3P20749 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BCL3P20749 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BCL3P20749 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms