Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2B1P20020 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms