Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNNI3P19429 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms